主要问题有：北京市空气重污染应急预案中，将自2016年10月停止生产至今仅从事售后及仓储的北京高阳采暖设备有限公司列入停限产企业名单。
沧州市新华区住建局制定的应急预案在出现重污染天气时无具体响应措施，对施工工地扬尘监管仅停留在汇报上，无具体处罚措施。高新区重污染天气应急预案停限产企业清单仅有2家企业，且该区最大的大气污染物排放源达力普石油管道有限公司未纳入停限产企业名单。
唐山市迁西县商务局重污染天气专项应急方案不实，无针对措施，无落实清单。
廊坊市永清县建成区气代煤2016年强化措施任务未完成，市里要求完成气代煤任务16945户，该县仅2200多户完成通气任务。
太原市《关于进一步加大冬季大气污染严控工作力度的通知》要求冬防十二条措施延长至2017年3月15日，在此期间，所有渣土车辆全部停运。夜查中发现2辆渣土车辆正在运输渣土，苫盖不严，造成扬尘和道路遗撒。晋源区政府《重污染天气应急预案》部分企业应急措施不可操作，无法取得污染物减排效果。预案要求太原紫鑫包装有限公司在发布黄色预警后停止运行燃煤设施。检查发现，该企业已完成煤改气工作，现使用天然气。经询问，该企业负责人不知道重污染天气应急要求。经调阅企业锅炉台账发现，该企业在重污染天气应急响应期间天然气消耗量与平时相比没有变化。
临汾市襄汾县重污染天气应急预案中确定的23家应急限产、限排企业中，有8家在预案启动前就属于停产状态。襄汾县政府与县工商质监部门提供的燃煤锅炉数据出入较大，存在底数不清的问题，襄汾县政府称全县燃煤锅炉共55台，但工商和质量技术监督局提供的材料中全县燃煤锅炉128台。
郑州市新郑应急预案减排清单不全，应急预案减排清单中涉及使用燃煤锅炉企业仅2家，现场发现至少4家企业的5台锅炉未纳入清单。
此外，部分企业存在环境问题：北京市跃通水泥制品有限公司为重污染天气应急停限产企业，向政府有关部门报告自2016年11月底至2017年2月20日停产。检查发现，电费缴费单显示2016年12月用电量未减少，甚至比正常生产月份高。