在中央环保督察的带动下，各省级环保部门对205个市(区、县)政府开展了综合督查，对环境问题突出的33个市县政府进行公开约谈，对工作任务不落实、问题突出的5个市县实施了区域环评限批。
吕忠梅表示，过去环保部门在环境治理过程中既当“运动员”，又当“裁判员”，而新《环保法》实施后，环保部门更多是做好“裁判员”的角色。“大环境变了，新《环保法》赋予环保部新的职能定位，赋予它更多监管的权利。”
在督政的同时，对企业的严管重处也同步进行。
新环保法提出了对企业“按日计罚、查封扣押、停产限产”等更具强制力和威慑性的处罚手段。
2015年，全国实施按日连续处罚715件，罚款数额5.69亿元，查封扣押4191件;2016年，按日连续处罚1017件，查封扣押9976件，停产限产5673件，分别比2015年增长138%、83%和42%。
“总的看，环境守法的态势正在逐步形成。”在2017年3月9日的记者会上，陈吉宁如是说。
兑现承诺：358家“红顶”环评机构全部“摘帽”
“我们决不允许‘卡着审批吃环保、戴着红顶赚黑钱’”。
2015年3月全国“两会”期间的记者会上，被问及巡视组点名环评领域存在的种种问题时，陈吉宁这样表态。
也是在这次记者会上，陈吉宁公开承诺：环保部所属事业单位的8个环评机构，率先全部从环保部脱离，其他地方的分批、分期也要全部脱离，逾期不脱离的，一律取消环评资质。
作为环境保护源头预防最重要的管理制度，环评担负着保障国家环境安全、维护公众环境权益的重大责任。
当月，环保部党组会议就通过了《全国环保系统环评机构脱钩工作方案》，进一步明确了“红顶”环评机构脱钩时间表：部属8家环评机构于2015年底前要率先脱钩，省级及以下环保系统环评机构，则分别在 2016年6月30 日、12月31日前要全部脱钩。
在责令“红顶”环评机构“摘帽”的同时，环保部还对存在问题的环评机构及其人员进行清理和通报：
2015年10月，环保部决定对中国工程物理研究院等6家环评文件编制质量较差的机构予以限期整改;对存在挂靠行为的吴冬梅等16名环评工程师给予通报批评，记入环评诚信信息系统。
